? 生物醫藥行業(yè)的技術(shù)盛會(huì )
7月17-19日,由中國藥學(xué)會(huì )主辦的“第七屆中國藥學(xué)會(huì )生物技術(shù)藥物質(zhì)量分析研討會(huì )”盛大召開(kāi),來(lái)自生物醫藥及科研領(lǐng)域的多位專(zhuān)家及現場(chǎng)近300位行業(yè)人士相聚夏日炎炎的北京,共同探討生物醫藥行業(yè)內的研究進(jìn)展及前沿技術(shù)。
賽默飛色譜質(zhì)譜生物制藥業(yè)務(wù)發(fā)展經(jīng)理唐愷帶來(lái)《基于高分辨質(zhì)譜平臺的宿主細胞殘留蛋白(HCPs)檢測》的解決方案,助力生物醫藥行業(yè)解決HCPs分析難題。
賽默飛色譜質(zhì)譜生物制藥業(yè)務(wù)發(fā)展經(jīng)理唐愷
什么是HCPs?為什么需要關(guān)注HCPs?
重組蛋白類(lèi)藥物是由遺傳修飾的原核或真核宿主細胞培養/發(fā)酵產(chǎn)生,由于細胞凋亡/死亡/裂解,其他非必需蛋白質(zhì)也可能釋放到細胞培養基/發(fā)酵液中,因此殘留在終產(chǎn)品中的其他蛋白質(zhì)即為宿主細胞殘留蛋白(HCPs)。
HCPs的存在會(huì )影響藥物的安全性和有效性,以及具有蛋白水解活性的HCPs影響藥物產(chǎn)品的穩定性,因此生物醫藥公司不斷優(yōu)化其純化工藝,從而控制終產(chǎn)品中HCPs的種類(lèi)和含量。
現有分析方法有哪些不足?
目前ELISA方法因其高靈敏度、高通量和易操作優(yōu)勢成為工業(yè)界的金標準,但仍存在很多限制。包括:
1.不能對HCPs進(jìn)行鑒定,低豐度HCPs的檢測易受限于高豐度蛋白的干擾;
2.定量動(dòng)態(tài)范圍(3個(gè)數量級)較低,抗體受限,開(kāi)發(fā)周期長(cháng);
3.無(wú)法改變已有的方法,缺少校正標準限制定量的準確性,因此需多種檢測方法相結合。
高分辨質(zhì)譜技術(shù)的優(yōu)勢
隨著(zhù)高分辨質(zhì)譜技術(shù)性能的不斷提升,已具有高靈敏度和寬的定量動(dòng)態(tài)范圍,以及蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)的飛速發(fā)展,可實(shí)現對未知蛋白質(zhì)的高通量定性和定量。
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組合型四極桿Orbitrap質(zhì)譜儀
基于nanoLC-MS/MS高靈敏平臺的方法,如何對HCPs進(jìn)行準確定性和相對定量呢?
一、樣品前處理
2017年禮來(lái)制藥公司Huang, Lihua, et al.在A(yíng)nalytical Chemistry雜志上發(fā)表中的方法是,以NIST抗體標準品為例,在蛋白質(zhì)非變性的條件下進(jìn)行酶切,抗體主成分被部分酶切,酶切后經(jīng)90度高溫變性,未被酶切的部分將被沉淀去除,從而提高HCPs的鑒定幾率和方法的動(dòng)態(tài)范圍。
我們在此基礎上進(jìn)一步優(yōu)化,縮短前處理時(shí)間提高工作效率,同時(shí)為考察此套流程對1-100ppm的HCPs的鑒定和相對定量能力,加入內標蛋白UPS2(48種蛋白,6個(gè)不同濃度)進(jìn)行定性和相對定量。
圖1.樣品前處理流程示意圖(來(lái)自Huang, Lihua, et al.)
二、儀器、色譜柱、數據分析軟件
目前根據液相色譜的流速可分為納升液相色譜(nanoLC,<1µL/min)、毛細管液相色譜(capillaryLC,1-1µL/min)、微流速液相色譜(microLC,10-100µL/min)、分析流速液相色譜(LC,>100µL/min),由于樣品單位濃度和離子化效率依次下降,因此其靈敏度逐漸下降,本次實(shí)驗采用靈敏度zui高的納升液相系統。
三、實(shí)驗結果
1.定性結果:
內標蛋白UPS2中含有48種內標蛋白6個(gè)不同濃度,共鑒定其中24種,其實(shí)際含量結果如表1,含量范圍為0.05-444.88ppm,實(shí)際含量>1ng(10ppm)的16種內標蛋白全部鑒定到,實(shí)際含量在0.06-0.38ng(0.6-3.8ppm)范圍內共鑒定到6種,此方案的靈敏度足以滿(mǎn)足生物藥領(lǐng)域客戶(hù)的需求。
表1.本次實(shí)驗中鑒定到UPS2內標蛋白的種類(lèi)及其實(shí)際含量
2.蛋白相對定量結果:
本次實(shí)驗進(jìn)行HCPs的相對定量,采用蛋白TOP3的特異性肽段峰面積的平均值算法,得出每種蛋白的峰面積,經(jīng)過(guò)三次技術(shù)重復,對特異性肽段大于等于1的蛋白峰面積進(jìn)行統計,平均峰面積分布如圖3A,峰面積大于1e?的蛋白為此樣品的主抗體,可看出本實(shí)驗定量范圍達6個(gè)數量級。UPS2內標蛋白的峰面積與含量的分布如圖3B,峰面積與含量存在一定的線(xiàn)性關(guān)系, HCPs的相對含量可根據其峰面積進(jìn)行初步判斷,進(jìn)而優(yōu)化純化工藝。
圖3A.特異性肽段大于等于1的蛋白峰面積分布圖
圖3B.內標蛋白UPS2的峰面積(log2)與其含量的分布
基于UHPLC-MS/MS平臺的方法:
UHPLC-MS/MS對于低含量HCPs的檢測時(shí),需提高上樣量(至少是納升液相系統的50倍)以提高其靈敏度。
經(jīng)實(shí)例驗證此方法同樣滿(mǎn)足當前大部分需求,某抗體藥物的HCPs經(jīng)ELISA定量為5ppm,UHPLC-MS/MS能夠準確鑒定到6種HCPs(unique peptides≥2),通過(guò)內標UPS2確定其檢測限達1ppm,6種HCPs的相對含量在1-10ppm內。
小結
隨著(zhù)蛋白質(zhì)組學(xué)的飛速發(fā)展,賽默飛Orbitrap高分辨質(zhì)譜,可采用納升液相,超液相兩種方式,定性和相對定量分析HCPs,LOD均低至1ppm以下,為傳統的ELISA方法補充更為豐富的信息,進(jìn)一步幫助生物醫藥企業(yè)優(yōu)化純化工藝,監控終產(chǎn)品和過(guò)程產(chǎn)物中的HCPs含量。